A közpénzek felhasználásával, a köztulajdon használatának nyilvánosságával, átláthatóbbá tételével és ellenőrzésének bővítésével összefüggő egyes törvények módosításáról szóló 2003. évi XXIV. törvény (elterjedt néven üvegzseb törvény) az Államháztartásról szóló 1992. évi XXXVIII. tv. egyes rendelkezéseit módosította. Közzétételi kötelezettséget ír elő az államháztartás pénzeszközei felhasználásával, az államháztartáshoz tartozó vagyonnal történő gazdálkodással összefüggő, nettó ötmillió forintot elérő vagy azt meghaladó értékű szerződésekre. E törvényt a 2012. évi LXXVI. törvény 6. § (2) bekezdés 59. pontja hatályon kívül helyezte, ám ez nem érinti a hatályon kívül helyező törvény hatálybalépése előtt keletkezett, megszüntetett vagy módosított jogviszonyokat, jogokat és kötelezettségeket.

Az MTA Szigetközi Munkacsoport keretében folyó kutatásoknak csak egy részére vonatkozik a nyilvánosságot előíró törvényi előírás. Az áttekinthetőség érdekében, a jelen oldal valamennyi szigetközi kutatás támogatását tartalmazza a 2007-2013 időszakra.

A Magyarország 2012. évi központi költségvetéséről szóló 2011. évi CLXXXVIII. törvény a Szigetközi térség vízügyi feladatainak elvégzése hivatott fejezeti kezelésű előirányzatot megszüntette. 2012-ben a kormányzat nem támogatta a szigetközi kutatásokat.

A Vidékfejlesztési Minisztérium 2013-ban saját költségvetési fejezetéből biztosított 10 millió forintot a feladatok ellátására. Az "1950/2013. (XII. 17.) Korm. határozat a Szigetköz ökológiai monitoringját végző intézmények támogatása érdekében a Vidékfejlesztési Minisztérium és az Emberi Erőforrások Minisztériuma valamint a Magyar Tudományos Akadémia fejezetek közötti előirányzat-átcsoportosításról" hozott határozat rendelkezik a pénzek átcsoportosításáról.